樣品要求及注意事項(xiàng)
1. 樣品要求
      不同來源的環(huán)境樣品中含有的DNA量差異很大,用于DNA提取時(shí)所需質(zhì)量有所差異。環(huán)境樣品一般存儲(chǔ)于無菌的10-50 ml的離心管中。如果是提取的DNA樣品,一般存儲(chǔ)于無菌的1.5 ml離心管中。
 
環(huán)境樣品(用于基因組DNA提取) DNA
土壤:5-10 g; 微生物群落分析:請將提取的DNA稀釋成濃度為10ng/ml,提供體積大于20ml的DNA溶液。OD260/280介于1.8-2.0之間,并確保DNA無降解
底泥:5-10 g; 宏基因組分析:提供濃度大于50ng/ml,體積大于60 ml的DNA,并確保DNA無降解
水體:1-3 L水樣用0.22 mm濾膜過濾后的濾膜 宏轉(zhuǎn)錄組分析:提供濃度大于50ng/ml,體積大于80 ml的DNA,并確保RNA無降解
糞便:1-5g;  
腸道內(nèi)容物:2-5 g;  
粘膜:指甲大小或更多  
植物內(nèi)生菌:15-30g葉片;3-10g根系;  
血液:10ml  
葉片:50-100g  
 
2. 樣品保存及郵寄的注意事項(xiàng)
       請將制備好的DNA或者RNA樣品保存在TE buffer 或超純水中,置于1.5 ml離心管中。用封口膜封好,并用記號筆或標(biāo)簽清晰、準(zhǔn)確地標(biāo)記樣品編號、日期、姓名。如需長期保存,請置于-80℃低溫冷凍箱內(nèi)。但為防止樣品降解對測序的影響,我們接受的DNA 樣品凍存時(shí)間不超過三個(gè)月,RNA樣品凍存時(shí)間不超過一個(gè)月。運(yùn)輸中請使用足量的干冰,以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。郵寄樣品時(shí)請將1.5 ml 離心管放置于50 ml 的大離心管中,以防運(yùn)輸過程中碰撞彈開蓋子。
      請您對遞交的每一份樣品在您實(shí)驗(yàn)室留有足量的備份。深度測序技術(shù)流程復(fù)雜,在建立測序文庫及上機(jī)測序過程中可能因不可控因素而出現(xiàn)失敗導(dǎo)致樣品損失,所以請確保測序失敗后仍有足夠量樣品做再次測序。